Η DODEKANISOS SEAWAYS είναι πιστοποιημένη σύμφωνα με τις διατάξεις του κώδικα ISM (Απόφαση ΙΜΟ Α.741 (18) όσον αφορά την Ασφάλεια και την Πρόληψη της Ρύπανσης και καθίστανται υποχρεωτικός για Ε/Γ-Ο/Γ ΠΛΟΙΑ πλοία που εκτελούν ταξίδια μεταξύ Ελληνικών λιμένων, σύμφωνα με κανονισμό (Ε.Κ.) αριθμ.3051/95 του Συμβουλίου της Ευρωπαϊκής Ένωσης της 8-12-95 και της Απόφασης του ΙΜΟ για Ε/Γ Ταχύπλοα
Το προσωπικό των πλοίων και της εταιρείας εκπαιδεύεται διαρκώς με γυμνάσια ανάγκης και σεμινάρια ώστε να μπορεί να ανταποκριθεί στις όποιες ανάγκες προστασίας της ανθρώπινης ζωής και του περιβάλλοντος .
Τα πλοία της Δωδεκάνησος Ναυτιλιακής διαθέτουν σύγχρονα μέσα πρόληψης, ανίχνευσης και κατάσβεσης πυρκαγιάς, ενώ τα υλικά των πλοίων είναι πυρίμαχα
Ενώ τα πλοία της Δωδεκάνησος Ναυτιλιακής έχουν εξοπλιστεί με τα πιο σύγχρονα σωστικά μέσα:
Με συνεχείς περιπολίες του πληρώματος κατά τη διάρκεια του ταξιδιού ελέγχονται πλήρως:
Σε κάθε χώρο του πλοίου υπάρχουν φωσφορίζουσες πινακίδες που οδηγούν με ασφάλεια στα σωστικά μέσα και στα σημεία διαφυγής.
Όλα τα πλοία της εταιρείας διαθέτουν επίσης: